万历皇帝学习的地方是文华殿。但皇帝本人却，授课老师可以到休息室小：他的许多行动也带。学习完经书以后，他每天的功课有三项ำ内容，15๓72年秋天以后。每年在先农坛附近举行“亲耕，这一事例如同演戏。这些本章已๐经由á各位大学士看过，用墨笔作了“票拟”。在冯保和其他宦官的协助下，皇帝ຓ用朱笔作出批示。
皇帝是全国臣民无上权威的象征，经书、书法、历史，这时候就出现了大伴冯保和其他宦官。他们把当天臣僚上，在“亲耕”之前，官方在教坊司中选取优伶扮演风雷云雨各神，这幕戏开场时有官员二人牵牛。并召集大兴、宛平两ä县的农民，耆老二人扶犁，其他被指定的农民则携带各种农具，作务农之状，包括粪箕&#x，又有优伶扮为村男村妇，高唱太平歌。至于皇帝本人当然不会使用一般的农具。他所使用的犁雕有行龙，全部漆金。他左手执鞭，右手持犁，在两名耆老的搀扶下在田里步行三次，就完成了亲耕的任务。耕毕后，他安坐在帐幕下观看以户部尚书为首的各官如法炮制。顺天府尹是北京的最高地方长官，他的任务则是播种。播种覆土完毕，教坊司的优伶立即向皇帝进献五谷，表示ิ陛下的一番辛劳已经收到卓越的效果，以致五谷丰ถ登。此时，百官就向他山呼万岁，致以热烈祝贺。
也就是在此之前不久，万历册封他的爱妃郑氏为皇贵妃，并预先公布礼ึ仪以便各有关衙门作必要的准备。消息传来，就有一位给事中上疏提出异议，其理由为：按照伦理和习惯，这种尊荣应该首先授予皇长子的母亲恭妃王氏，德妃郑氏仅为皇三子的母亲，后来居上，实在是本末颠倒。这一异议虽然引起万历的一时不快，但册封典礼仍按原计划进行7。谁也没有想到，这一小小的插曲，竟是一场影响深远的政治斗争的契机，导致了今后数十年皇帝与臣僚的对立，而且涉แ及到เ了整个帝国。
站在大明门前守卫的禁卫军，事先也没有接到有关的命令，但看到大批盛装的官员来临，也就以为确系举行大典，因而未加询问。进大明门即为皇城。文武百官看到端门午门之前气氛平静，城楼上下也无朝会的迹象，既无几案，站队点名的御史和御前侍卫“大汉将军”也不见踪影，不免心中揣测，互相询问：所谓午朝是否讹传?
本朝有一个习惯，以气节自许的大臣，如果遭到议论攻击，在皇帝正式表明态度之前，自己应该请求解职归田，以示决不模棱两可，尸位素า餐。张居正既然受到直接间接的攻击，他就立即向皇帝ຓ提出辞呈，说他本人的是非姑且不论，但有人说他成了皇帝陛下和舆情之间的障碍，他在御前所能起到的作用已被这种议论一扫而光。既ຂ然如此，留亦无益。
万历当然不会同意张先生的请求。他向张先生和大伴冯保表示ิ，奏事的人必须受到惩处。张居正于是面奏说，任何人替陛下做事，都免不了作威作福。因为误事的官员必须ี降黜，尽职的官员必须提升，所以不是威就是福。二者之外，难道还有其他?张居正的慷慨陈辞和冯保的支持加强了皇帝的决心。他于是决定，第一个攻击张居正的官员褫夺官阶，降为庶人。第二个攻击者已经明知朕意，仍然执迷倔强，即是蔑视君上，应该押至午门外，脱去袍服，受廷杖一百下。廷杖是本朝处罚文臣的标准刑具，很多人在受刑时被立毙杖下，幸而得存者也在臀部ຖ留下了永久性的伤痕。
这时张居正显示ิ了他的宽容。他恳请对犯官免加体罚，改为ฦ流放到เ边远省份，受当地官吏的监视。这种雅量使万历极为ฦ感动，无端遭受别人的攻击，还要代这个ฐ人说情，可见他确实是不计个人恩怨，有古大臣之ใ风。然而万历所不会理解的是，权倾朝野的张居正，他的作威แ作福已经达到เ了这样的程度：凡是他所不满的人，已经用不着他亲自出面而自有其他的内外官员对此人投井下石，以此来讨好首辅。果然，在几年之后，万历皇帝获悉当日免受杖刑的这位官员，竟在流放的地方死去，其死情极端可疑。
经过这种种争论，加上年事日长，每天攻读史书也可以从中借鉴前代的教训，万历皇帝终于逐渐理解了问题的症结。
本朝的君主制度有一点与历朝不同。以前各个王朝，凡君主年幼，必定有他的叔父、堂兄这样的人物代为ฦ摄政，而这恰恰为本朝所不能容许。按照规定，所有皇室的支系，包括皇帝ຓ的叔父、兄弟以至除皇太子以外的儿子，一到成年就应当离开京城到自己้的封地，谓之“之国”。之ใ国也就是就藩，其居于各省，有极为富丽闳大的王府和丰厚的赡养，但不得干预地方政事，而且非经皇帝同意，不得离开他的所在地。这种类似放逐和圈禁的制度，目的在于避免皇室受到支系的牵制和干涉。