艾丽斯从第一集的生化丧尸中逃离，
T－病毒仍然在拉科恩城内肆虐。继续和丧尸的战斗，
除了面对丧尸大军、变种怪，现在她必须担负起保护人类的工作，经过保护伞公司地。可是她却依然逃不出生化危机的恶梦，他们遇到了更加强大的敌人，这个被称为“复仇女神（nemesis）”的怪物是第一集中受伤的马特，以解决整个人类陷入基因突变的绝境。为了这个目的，同时也是为了找出和拯救浣熊市内可能幸存的同胞，艾丽斯和刚刚遭到降职处分的特种防卫队队员吉儿、以及佩顿、LJ、泰瑞以及队长卡洛斯组成调查组，再一次深入到拉科恩城腹地。她被赋予了人的力量度和感知能力，那些感染病毒的丧尸也成为，必须在它们更加强大之前找到T－病毒的来源和有效控制它的方法，它被输入了毁灭一切生物的指令，并且它还拥有强大的电磁炮和火箭弹拥有惊人的破坏力。保护伞公司在逼不得已的情况，
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故事最终，开启最终计划“消毒”，说是“消毒”，但是最终病毒并没有完全消灭…。其实是使用核弹将整个城市毁灭